DES SCIENTIFIQUES DECOUVRENT UNE MUTATION UNIQUE DU NOUVEAU CORONAVIRUS

Les chercheurs ont identifié une mutation dans le code génétique du SRAS-CoV-2 qui reflète les changements observés par les scientifiques lors de l'épidémie de SRAS de 2003.

illustration de coronavirus
Une mutation récemment découverte dans le SRAS-CoV-2 éclaire la façon dont l'épidémie actuelle pourrait évoluer.

Le SRAS-CoV-2 est le virus qui cause la maladie COVID-19. Dans la mutation, 81 lettres du génome du virus avaient été supprimées.

Les mutations virales font partie intégrante de l'évolution d'un virus et peuvent altérer la gravité de la maladie qu'elles provoquent.

Dans le cas du SRAS-CoV-2, la découverte est intéressante car la nature de la mutation suggère qu'elle peut avoir une association avec une forme moins sévère de la maladie. Un virus moins virulent peut avoir un avantage sélectif sur d'autres souches.

La recherche, par une équipe de scientifiques de l'Arizona State University (ASU), États-Unis, est maintenant une pièce de correspondance dans le Journal of Virology .

Mutations

Alors que certains chercheurs ont concentré leur attention sur le suivi du nombre de cas de COVID-19 contre la propagation mondiale du SRAS-CoV-2, d'autres suivent le virus lorsqu'il commence à muter, créant des changements dans son code génétique qui peuvent affecter la façon dont il les fonctions.

Des mutations se produisent lorsqu'un changement de matériel génétique s'intègre dans le génome viral et se transmet à la génération suivante. Dans le cas des virus, une génération est généralement le cycle d'infection d'une cellule particulière.

L'équipe de l'ASU effectuait à l'origine des recherches sur les virus de la grippe, analysant des échantillons d'écouvillons nasaux prélevés sur des participants en Arizona.

Cependant, une fois que les autorités sanitaires ont commencé à confirmer les cas de COVID-19 en Arizona, l'équipe a décidé de déplacer ses recherches pour se concentrer sur le SRAS-CoV-2.

Selon le Dr Efrem Lim, professeur adjoint à l'École des sciences de la vie de l'ASU et chef de l'équipe de recherche, «[c] était l'occasion scientifique d'une vie pour l'ASU de pouvoir contribuer à comprendre comment ce virus est propagation dans notre communauté. En tant qu'équipe, nous savions que nous pouvions faire une différence significative. »

Séquençage nouvelle génération

Après avoir retiré les écouvillons nasaux de la grippe de leur étude, l'équipe disposait de 382 échantillons. Parmi ceux-ci, ils ont confirmé que cinq contenaient du SRAS-CoV-2.

L'équipe a ensuite effectué le séquençage de nouvelle génération sur l'ARN des échantillons du SRAS-CoV-2, ce qui leur a permis de déterminer rapidement les 30 000 caractères du code génétique du virus.

Après les avoir comparés à des séquences de SARS-CoV-2 déposées dans la base de données EpiCoVTM à but non lucratif de GISAID , il est devenu clair que l'un des virus avait une mutation unique qui impliquait la suppression de 81 lettres de son génome.

Pour le Dr Lim, «[l] e des raisons pour lesquelles cette mutation est intéressante est qu'elle reflète une grande suppression qui s'est produite lors de l'épidémie de SRAS de 2003».

Des recherches antérieures ont suggéré que des suppressions similaires réduisaient la capacité du coronavirus au cœur de l'épidémie de SRAS de 2003 à se répliquer. Un virus affaibli peut avoir un avantage sélectif réduit à court terme - mais il peut avoir un avantage sélectif accru à moyen et long terme.

Les suppressions que l'équipe ASU a identifiées dans SARS-CoV-2 affectent les parties du code qui produisent une protéine particulière. Les scientifiques pensent que cette protéine est essentielle pour aider le SRAS-CoV-2 à échapper aux défenses humaines, lui permettant de se répliquer rapidement.

Besoin de recherches supplémentaires

La mutation du virus peut être utile pour aider les scientifiques à mieux comprendre comment le SRAS-CoV-2 rend les gens malades. De même, cela peut aider au développement de médicaments antiviraux qui peuvent réduire la gravité de la maladie jusqu'à ce qu'un vaccin efficace arrive.

Cependant, les scientifiques doivent d'abord faire plus de recherche. L'équipe de l'ASU explore actuellement précisément l'effet de la mutation sur le fonctionnement du virus.

Les chercheurs se sont également associés au Translational Genomics Research Institute, à l'Université de l'Arizona et à la Northern Arizona University pour créer l'Arizona COVID-19 Genomics Union, qui a l'intention d'étudier plus avant les mutations du SARS-CoV-2.